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彭进 (彭进.)

Abstract:

摘  要
目的:
应用分子生物学技术,采用DNA扩增后直接测序、克隆测序分析技术,并结合血型血清学方法,研究中国人群MNS血型GYPA和GYPB的多态性以及建立Diego血型基因分型方法,对比基因和抗原检测结果的相关性,建立适合中国人群的血型基因分型技术,为临床输血医学和血型相关疾病、法医学等领域的研究提供理论依据,并可以有效提高输血保障能力和水平。
方法:
1. MNS和Diego血型基因检测方法的建立
(1)样本采集:随机选取来自西安市地区的健康无偿献血者,采集静脉血5 ml并以EDTA-K2抗凝保存(310例用于检测MNS血型抗原,610例用于检测Mur抗原,1500例用于检测Diego抗原)。
(2)DNA提取:采用天根全血DNA抽提试剂盒(滤柱法)提取全血组DNA,按试剂操作说明书进行。
(3)PCR扩增:依据基因序列的差别设计引物,扩增GYPA第2、3、4外显子,GYPB第3外显子;根据GYP(B-A-B)Mur与GYPA/GYPB的差异位点设计引物,通过优化条件扩增Mur基因;根据在第19外显子2561位上碱基的差异设计引物,扩增DIA和DIB。
(4)PCR产物测序和比对:将所获PCR扩增产物采用2 %琼脂糖凝胶电泳(200 V,15 min),在紫外灯下观察结果;将扩增产物送交测序,测序引物为扩增引物。测序结果在Genbank数据库比对,测序图用Chramos软件读取。
(5)本检测Mur基因方法与血清学方法结果比对:对检出MUR阳性的样本采用已知的抗-Mur检测,并随机抽取20例MUR基因检测结果为阴性的样本,同样用抗-Mur检测。
(6)本检测Diego基因方法与进口商品试剂检测方法及血清学方法结果比对:采用天津秀鹏和德国Inno-train出品的Diego血型系统基因分型试剂盒进行平行对比,操作按照试剂盒说明书进行,对检出的Di(a+b+)及随机挑选20例Di(a-b+)样本扩增后进行测序。依照抗-Dia的说明书采用间接抗球蛋白法对样本进行血清学方法检测Dia抗原。
2. MNS和Diego血型基因多态性的检测
(1)MNS的血型基因多态性的检测:用本研究建立的MNS基因分型方法,检测了本地区310例献血者样本,确定其MNS血型。对比了北京及深圳的MNS基因数据。用建立的Mur基因分型方法筛查了本地区610例献血者样本。
(2)Diego血型基因多态性的检测:用本研究建立的Diego基因分型方法,筛查了本地区1500例献血者样本,研究Diego血型基因的多态性。
结果:
1. MNS和Diego血型基因检测方法的建立
PCR扩增样本GYPA第2、3、4外显子和GYPB第3外显子的产物测序,与标准参照序列进行比对,两者序列完全吻合,证实扩增基因为目的基因。PCR方法扩增Mur(GYP(B-A-B))产物为988 bp,条带清晰,扩增产物的测序图经比对确认为Mur基因(GYP(B-A-B))序列;大样本量检测本地区人群Mur基因,对检出的阳性样本和随机抽取的20例阴性样本采用IgM抗-Mur血清学方法检测,结果与基因检测的结果完全吻合。用秀鹏和Inno-train试剂盒检测所有基因型为DI(a+b+)样本及随机挑选20例基因型为DI(a-b+)的样本,结果与本法一致,对样本扩增后测序,测序结果与Genbank上的SLC4A1相关序列进行比对,测序结果显示序列与SLC4A1完全相同,说明扩增产物特异性好,测序结果与基因分型结果一致。用单克隆IgG-Dia采用间接抗球蛋白法对样本红细胞进行检测,与基因分型检测结果一致。以上结果表明,本研究建立的MNS和Diego血型基因检测方法具有很好的特异性,准确可靠,可用于下一步大样本量的研究。
2. MNS和Diego血型多态性分析
用本研究建立的MNS基因分型方法检测了本地区310例样本中,M+N- 80例,占25.8%;M-N+ 84例,占27.1%;M+N+ 146例,47.1%;未发现有M-N-样本;S-s+ 279例,占90.0%;S+s+ 31例,占10.0%;未发现有S+s-及S-s-样本。通过对较大样本的测序检测还发现,GYPA的第3和第4外显子均未发现有新的突变,说明中国人的GYPA的第3和第4外显子序列保守。根据M基因中第1内含子1中有1个G/T突变位点,在M等位基因中又鉴定区分出MG和MT基因,虽然存在这个位置上的突变,但是并未影响血清学即用抗-M的检测结果,说明这个位于内含子的突变对抗原的表达不会产生影响。本研究对比了西安与北京及深圳的相关基因数据,西安地区人群无论M基因的构成比,还是NN纯合子型以及MGMT型、MGN型、MGMG型等特征性的基因型的构成和频率,都存在统计学上的差异,提示这样的差异有可能是地方性基因遗传特征。发现在GYPA第2内含子中有65例样本存在在第59与60位碱基位置插入T碱基引起的碱基移码突变,在西安地区人群中发生率为21.0%(65/310),T碱基的插入不会影响抗原的表达。对GYPB第3外显子的测序后未发现样本中有新的突变,说明西安地区人群的GYPB基因保守。在对610例西安地区人群的检测中,发现9例Mur+样本,并用IgM抗-Mur进行了平行验证。在1500例样本中,共检测到基因型为DI(a+b-)1例,基因型为DI(a+b+)78例,基因型为DI(a-b+)1421例,未检测到DI(a-b-)基因型样本。
结论:
本研究成功建立了MNS和Diego血型的基因检测方法,并利用该方法对西安地区人群MNS和Diego血型的多态性进行了分析,MNS血型以M+N+和S-s+最为常见,Diego血型以DI(a-b+)最为常见。为提高输血安全以及法医学等领域的研究提供了理论依据,具有重要的理论和应用价值。

Keyword:

Diego血型 GYPA GYPB Mur血型 红细胞血型 基因分析

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  • [ 1 ] 西安交通大学医学部

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Basic Info :

Degree: 医学硕士

Mentor: 王军阳

Student No.:

Year: 2017

Language: Chinese

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