当前，主要发达国家和发展中国家都把科技企业孵化器的建设作为培育中小科技企业发展、激发地方经济发展的重要方式之一。科技企业孵化器在中国发展十七年来，已经成为中国高新技术产业发展中的一支重要力量。而在西安这样拥有丰富科技资源、但经济相对落后的城市，研究科技企业孵化器运行效率的改进尤其具有重要的战略意义和现实意义。本文首先明确所要研究的问题，即西安高新区科技企业孵化器运行效率改进；其次，通过对国内外科技企业孵化器运行模式和存在问题的研究，说明运行效率改进研究对科技企业孵化器这种经济组织的必要性，并且综合阐述了本论文研究所涉及的管理学、经济学理论；再次，运用AHP方法和模糊评价法，提出科技企业孵化器运行效率评价指标体系，得出影响西安高新区科技企业孵化器运行效率的各因素间的结构关系和重要程度，分析出西安高新区科技企业孵化器运行效率结果，同时，通过孵化企业调查问卷分析，从企业经营角度分析西安高新区科技企业孵化器运行效率；接着，按照前面分析结果，提出提高西安高新区科技企业孵化器运行效率的相关改进设计；最后，得出本论文结论并提出要进一步研究的问题。本文提出科技企业孵化器运行效率的改进主要体现在对中小科技企业技术创新能力和市场能力的培育上，这种培育又集中体现在对形成中小科技企业集群和网络组织合作关系的培育及其对这一社会资本的充分利用上。