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李晓芳 (李晓芳.)

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背景:
宫颈癌作为女性生殖系统最常见且死亡率最高的恶性肿瘤之一,在全球女性肿瘤中发病率和死亡率均位于第四位,而在发展中国家,其发病率更是排名第二,严重影响女性健康。导致肿瘤患者死亡的主要原因是肿瘤转移,而淋巴结转移是宫颈癌转移的最主要途径,明确诊断患者淋巴结是否有转移是制定个体化治疗方案的关键因素。目前临床主要借助影像学以及手术探查来判断宫颈癌淋巴结转移状态,而影像学方法尚不能准确预测宫颈癌患者的淋巴结转移情况。肿瘤转移是多基因、多步骤参与的复杂调控的过程,而生物信息学方法可以利用大样本、高通量的基因测序结果同时对大量基因表达进行快速分析,高效筛选表达差异基因以及异常调节通路。
本研究利用公共数据库的大量样本测序结果对宫颈癌淋巴结转移的关键分子及信号通路进行研究,从而指导我们更好地了解宫颈癌淋巴结转移的过程,对指导临床诊断、制定治疗方案、预测生存期以及寻找转移的靶向治疗等有着很重要的临床意义。
目的:
1)挖掘宫颈癌淋巴结转移与非淋巴结转移样本中的差异基因、异常调节通路;
2)研究得到的重点基因MMP1对宫颈癌细胞增殖、迁移及侵袭能力的影响;
3)研究MMP1对宫颈癌恶性度影响的可能机制;
4)研究分析MMP1在宫颈癌患者中的临床意义。
方法:
1)通过生物信息学方法挖掘宫颈癌淋巴结转移与非淋巴结转移样本中的差异基因、异常通路并进行讨论与注释;通过交叉验证不同方法结果得到在不同聚类方法中均有显著意义的基因;
2)对上一步骤中的重点基因MMP1,在多种人宫颈癌细胞系以及正常人宫颈上皮细胞系中通过Western blot以及qRT-PCR检测其转录和翻译水平;
3)利用诱导型Crispr-Cas9技术建立MMP1敲除人宫颈癌单克隆细胞系,应用Western blot检测其表达情况,并应用细胞增殖、划痕、Transwell等细胞实验方法检测MMP1对SiHa和HeLa细胞恶性度的影响;
4)通过Western blot检测MMP1敲除与未敲除细胞系EMT经典分子,研究其在EMT过程中的作用;
5)寻找宫颈癌淋巴结转移与非转移样本中差异miRNA,并构建miRNA-mRNA网络,对宫颈癌淋巴结转移可能的调控机制进行探索
6)收集独立样本,通过卡方检验、Kaplan-Meier 生存分析、构建多因素Cox比例风险模型分析并绘制ROC曲线等探讨MMP1临床意义。
结果:
1)PPAR信号通路是在宫颈癌淋巴结转移过程中的重要通路;属于PPAR通路的MMP1是唯一一个在宫颈癌发生与淋巴结转移中均异常上调表达的基因;
2)MMP1在多个宫颈癌细胞系中较正常宫颈上皮细胞系在转录和翻译水平均上调表达;敲除MMP1后宫颈癌细胞系增殖、迁移和侵袭能力受到显著抑制;
3)敲除MMP1使E-cadherin升高,N-cadherin和vimentin下降;但其表达不影响转录因子slug的表达;
4)miR-599在宫颈癌淋巴结转移阳性病例中下调,并在miRNA-mRNA网络中调控MMP1;
5)宫颈癌是否发生淋巴结转移与MMP1表达显著相关;宫颈癌临床分期、是否发生淋巴结转移以及MMP1表达为宫颈癌患者独立预后危险因素;ROC曲线结果提示MMP1的表达水平对是否发生宫颈癌淋巴结转移有较好的指示作用。
结论:
1)PPAR信号通路为宫颈癌淋巴结转移过程中的重要通路,MMP1为宫颈癌发生以及淋巴结转移过程中的重点基因;
2)MMP1可以促进宫颈癌细胞系增殖、迁移和侵袭能力;
3)MMP1通过EMT过程影响宫颈癌细胞系转移侵袭;MMP1在宫颈癌中上调可能受到转录因子slug的调控;
4)miR-599可能在宫颈癌中发挥抑癌基因作用抑制MMP1表达,可成为宫颈癌淋巴结转移新的研究方向;
5)MMP1有望成为淋巴结转移的宫颈癌病人的生物学标记物以及宫颈癌独立预后因子。

Keyword:

EMT MMP1 宫颈癌 淋巴结 生物信息学

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  • [ 1 ] 西安交通大学医学部

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Degree: 博士

Mentor: 高艳娥

Student No.:

Year: 2018

Language: Other

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